Cabo San Lucas está catalogada como Área de Protección de Flora y Fauna desde 29/11/1973. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro de los estados Baja California y Baja California Sur, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, bosques templados, desiertos, matorrales y selvas secas.

La porción norte y la franja costera oriental, terrestres y marinas de la Isla de Cozumel está catalogada como Área de Protección de Flora y Fauna desde 25/09/2012. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, humedales, intermareales, manglares y selvas secas.

Sistema Arrecifal Lobos-Tuxpan está catalogada como Área de Protección de Flora y Fauna desde 05/06/2009. Se ubica en la regiones Planicie Costera y Golfo de México dentro del estado de Veracruz, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Arrecife Alacranes está catalogada como Parque Nacional desde 06/06/1994. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Yucatán, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Arrecife de Puerto Morelos está catalogada como Parque Nacional desde 02/02/1998. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Arrecifes de Cozumel está catalogada como Parque Nacional desde 19/07/1996. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Arrecifes de Xcalak está catalogada como Parque Nacional desde 27/11/2000. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Arrecifes del Golfo de México-Sur está catalogada como Parque Nacional desde 26/09/2024. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano, Planicie Costera y Golfo de México dentro de los estados Campeche y Yucatán, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Bahía de Loreto está catalogada como Parque Nacional desde 19/07/1996. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro de los estados Baja California y Baja California Sur, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, intermareales, manglares y matorrales.

Bajos del Norte está catalogada como Parque Nacional desde 08/01/2024. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Yucatán, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes y mar pelágico.

Cabo Pulmo está catalogada como Parque Nacional desde 06/06/1995. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro de los estados Baja California y Baja California Sur, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, intermareales y mar pelágico.

Isla Contoy está catalogada como Parque Nacional desde 02/02/1998. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, humedales, intermareales, manglares y matorrales.

Isla Isabel está catalogada como Parque Nacional desde 08/12/1980. Se ubica en la regiones Occidente y Pacífico Centro dentro del estado de Nayarit, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, intermareales y selvas secas.

Islas Marietas está catalogada como Parque Nacional desde 25/04/2005. Se ubica en la regiones Occidente y Pacífico Centro dentro del estado de Nayarit, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, intermareales y pastizales.

Sistema Arrecifal Veracruzano está catalogada como Parque Nacional desde 24/08/1992. Se ubica en la regiones Planicie Costera y Golfo de México dentro del estado de Veracruz, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Zona Marina de la Isla Isabel está catalogada como Parque Nacional desde 08/01/2024. Se ubica en la regiones Occidente y Pacífico Centro dentro del estado de Nayarit, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes y mar pelágico.

Zona marina del Archipiélago de Espíritu Santo está catalogada como Parque Nacional desde 10/05/2007. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro de los estados Baja California y Baja California Sur, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, intermareales, manglares, mar pelágico y marismas y estuarios.

Zona marina del Archipiélago de San Lorenzo está catalogada como Parque Nacional desde 25/04/2005. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro del estado de Baja California, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes y praderas de pastos marinos.

Arrecifes de Sian Ka'an está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 02/02/1998. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Banco Chinchorro está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 19/07/1996. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando el ecosistema Arrecifes.

Caribe Mexicano está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 07/12/2016. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, manglares, marismas y estuarios, praderas de pastos marinos y selvas húmedas.

Isla San Pedro Mártir está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 13/06/2002. Se ubica en la regiones Noroeste y Alto Golfo de California dentro del estado de Sonora, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, bosques de algas gigantes y matorrales.

Islas del Pacífico de la Península de Baja California está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 07/12/2016. Se ubica en la regiones Península de Baja California y Pacífico Norte dentro de los estados Baja California y Baja California Sur, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, manglares y matorrales.

Islas Marías está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 27/11/2000. Se ubica en la regiones Occidente y Pacífico Centro dentro del estado de Nayarit, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes, manglares y selvas secas.

Tiburón Ballena está catalogada como Reserva de la Biosfera desde 05/06/2009. Se ubica en la regiones Península de Yucatán y Caribe Mexicano dentro del estado de Quintana Roo, abarcando diversos ecosistemas como arrecifes y manglares.